El área administrativa es la encargada de velar por los recursos la Ciudad de los Niños, cómo llegan, cómo ejecutarlos y cómo controlarlos; además de las labores operativas de: reclutamiento, selección, contratación, inducción y capacitación del personal; compras de bienes y servicios, servicio de alimentación, entrega de productos a nivel interno, pagos a proveedores y personal, presupuesto institucional, construcción y mantenimiento de infraestructura, mantenimiento y seguimiento de la infraestructura de telecomunicaciones, del control interno de procesos, velar por el buen manejo de activos y materiales, y además de otras funciones que aportan a la operación de la Ciudad de los Niños.
Está compuesta por las siguientes unidades, liderado por un administrador:
Gestión Humana
Financiero Contable
Proveeduría
Tecnología de la información (TI)
Proyectos y mantenimiento.
Salud Ocupacional
Nutrición
Comedor institucional
Misceláneos y Mensajería